图形化界面的优点是集成性、易用性好；命令行方式的WINDOWS版本同UNIX版本， 适合高级用户，适合自动化执行。

但基于如下原因，必须使用命令行。

图形界面的PGP不能用于商业应用，而GPG不受限制。

使用GnuPG(gpg)的目的也是源于此。由于RSA，IDEA等算法在美、加的专利注册，使得我们在商业场合使用公开的算法技术成为必须。而gpg在这方面做的最好。